Jyväskylän maaseurakunnan alueet kuuluivat 1560 perustettuun Rautalammin emäseurakuntaan, josta ne siirrettiin Laukaaseen 1628. Jyväskylästä tuli rukoushuonekunta 1660 ja kappelioikeudet se sai 1693. Ensimmäinen oma kappalainen aloitti 1787. Jyväskylä erotettiin Laukaasta 1856 ja sai samalla Jämsästä Petäjäveden kappelin. Petäjävesi erottiin kuitenkin jo 1867 omaksi kirkkoherrakunnaksi. Vuonna 1837 perustettu Jyväskylän kaupunki sai oman saarnaajan 1863; kaupunki erotettiin 1875 omaksi emäseurakunnaksi, jolloin Jyväskylän seurakunnasta tuli maaseurakunta ja kaupungista kaupunkiseurakunta. (Maalaiskunta muutti nimensä myöhemmin Vaajakoskeksi.)
Toivakan rukoushuonekunta perustettiin 1871, sai kappelin oikeudet 1873 ja erotettiin omaksi kirkkoherrakunnaksi 1901. Kaupunkiseurakuntaan liitettiin 1908 Syrjälän ja Mäki-Matin alueet, sitten vuonna 1941 Nisula, Lohikoski, Tourula, Halssila ja Etu-Keljo ja vuonna 1944 Lahjaharju. Vuonna 1966 liitettiin kaupunkiin pitäjien keskiosa (Kuokkala, Tikka, Keljo, Taka-Keljo, Ritoniemi, Seppälänkangas ja Matinmäki, eli 80 m2 ja 5000 asukasta). Laukaan Palvajärven ja Vehniän lentokentän alue siirrettiin Jyväskylän maalaiskuntaan 1974.
Seurakunnassa on kolme piiriä: Palokka, Tikkakoski ja Vaajakoski. Tikkakoski on vuonna 1893 perustetun tehtaan ympärille muodostunut yhteisö, joka sai oman kirkon 1957. Vaajakoski on keskustaajama, jonka kirkko valmistui 1954. Palokan piiri on muodostunut 1978 valmistuneen kirkon myötä. Seurakunnan pääkirkko on kuitenkin Jyväskylässä, vuonna 1929 valmistunut Taulumäen kirkko.
- Kirkkoa ryöstettiin isonvihan aikana. Venäläiset polttivat 1808 nuotiossaan kirkkotarhan ympäri 1806 rakennetun hirsisen aidan. Kirkko sekä kellotapuli paloi 27/1 1918 perustuksiaan myöden. Kirkossa sattui 19/1 1934 tulipalo lämmityskellarin savutorven puupermannossa turmellen osan permantoa sekä kirkon sisämaalauksia. Vuoden 1793 tarkastuksessa oli historiakirjoja v:sta 1731 ja rippikirjoja v:sta 1737. Nyt ne alkavat edelliset 1766, jälkimmäiset 1777. [O. Durchman: Kirkonarkistojen tuhoutumiset. Genos 3(1932). Täydennys VI. Genos 5(1934). Täydennys VII. Genos 6(1935). Täydennys VIII. Genos 15(1944)]
| Selite | Nide | Vuodet | Huom | Filmi |
|---|---|---|---|---|
| Mikrokortit: | ||||
| Syntyneet | 1766-1805 | 1 | ||
| Syntyneet | 1805-1828 | 2 | ||
| Vihityt | 1766-1789 | |||
| Vihityt | 1789-1832 | 3 | ||
| Kuolleet | 1766-1786 | |||
| Kuolleet | 1786-1812 | 4 | ||
| Kuolleet | 1812-1832 | 5 | ||
| Syntyneet | 1829-1840 | |||
| Syntyneet | 1840-1850 | 6 | ||
| Vihityt | 1833-1850 | |||
| Kuolleet | 1833-1838 | |||
| Kuolleet | 1838-1850 | 7 | ||
| Rullafilmit: | ||||
| Syntyneet | I | 1766-1828 | 55588 | |
| II | 1829-1850 | |||
| Vihityt | I | 1766-1832 | ||
| II | 1833-1850 | |||
| Kuolleet | I | 1766-1832 | ||
| II | 1833-1850 |
| Selite | Signum | Vuodet |
|---|---|---|
| Rulla UK 412 | ||
| Rippikirja | B I 1 | 1770-1787 |
| Rippikirja | B I 2 | 1788-1805 |
| Rippikirja | B I 3 | 1807-1837 |
| Rippikirja | B I 4 | 1837-1844 |
| Rulla UK 413 | ||
| Rippikirja | B I 4 | 1837-1844 |
| Rippikirja | B I 5 | 1844-1853 |
| Rippikirja | B I 6 | 1854-1868 |
| Rulla UK 414 | ||
| Rippikirja | B I 6 | 1854-1868 |
| Lastenkirja | B II 1 | 1752-1787 |
| Lastenkirja | B II 2 | 1788-1804 |
| Lastenkirja | B II 3 | 1804-1832 |
| Lastenkirja | B II 4 | 1832-1844 |
| Lastenkirja | B II 5 | 1845-1848 |
| Lastenkirja | B II 6 | 1848-1853 |
| Lastenkirja | B II 7 | 1854-1868 |
| Rulla UK 415 | ||
| Lastenkirja | B II 7 | 1854-1868 |
| Syntyneet, vihityt, kuolleet | B III 1 | 1766-1795 |
| Syntyneet, vihityt, kuolleet | B III 2 | 1796-1832 |
| Syntyneet, vihityt, kuolleet | B III 3 | 1833-1860 |
| Syntyneet, vihityt, kuolleet | B III 4 | 1853-1872 |
| Rulla UK 416 | ||
| Syntyneet, vihityt, kuolleet | B III 4 | 1853-1872 |
| Aviokuulutuksia | 1848-1868 | |
| Rippilapsia | B VIII 1 | 1809-1869 |
| Muuttaneet | B VI 1 | 1840-1875 |
| Muuttokirjoja | B IX 1 | 1788-1825 |
| Muuttokirjoja | B IX 2 | 1825-1836 |
| Rulla UK 417 | ||
| Muuttokirjoja | B IX 2 | 1825-1836 |
| Muuttokirjoja | B IX 3 | 1837-1840 |
| Muuttokirjoja | B IX 4 | 1841-1844 |
| Muuttokirjoja | B IX 5 | 1845-1848 |
| Muuttokirjoja | B IX 6 | 1848-1852 |
| Rulla UK 418 | ||
| Muuttokirjoja | B IX 6 | 1848-1852 |
| Muuttokirjoja | B IX 7 | 1853-1856 |
| Muuttokirjoja | B IX 8 | 1857-1859 |
| Rulla UK 419 | ||
| Muuttokirjoja | B IX 8 | 1857-1859 |
| Pitäjänkokousten pöytäkirjoja | B VII 1 | 1803-1842 |
| Pitäjänkokousten pöytäkirjoja | B VII 2 | 1843-1870 |
| Tilejä | B XI 1 | 1807-1822 |
| Tilejä | B XI 3 | 1834-1890 |
| Kalustoluetteloita | 1817-1840 | |
| Perukirjoja | B X 3 | 1790-1831 |
| Rulla UK 420 | ||
| Perukirjoja | B X 3 | 1790-1831 |
| Perukirjoja | B X 4 | 1823-1864 |
| Perukirjoja | B X 5 | 1858-1884 |
| Rulla UK 421 | ||
| Perukirjoja | B X 5 | 1858-1884 |
| Sekalaisia asiakirjoja | 1817-1888 | |
| Sekalaisia asiakirjoja | 1792-1897 | |
| Rulla UK 422 | ||
| Sekalaisia asiakirjoja | 1792-1897 | |
| Sekalaisia asiakirjoja | 1803-1859 | |
| Sekalaisia asiakirjoja | 1851-1867 | |
| Sekalaisia asiakirjoja | 1787-1856 | |
| Rulla VÄ 98 | ||
| Väkilukutauluja | 1749-1764 | |
| Rulla VÄ 99 | ||
| Väkilukutauluja | 1765-1877 |
Kirkkoherrat
Nestor Järvinen (1881-88)
Karl Abel Heikel (1889-1904)
Gustaf Adolf Heman (1905-17)
Ludvig Sjöstedt (1918-28)
V. J. Vihemäki (1929-47)
Arvi Olavi Tukiainen (1949-73)
Toivo Armas Vuoristo (1974-92)
Jaakko Juhani Jaatinen (1992-)
Vt. kirkkoherrat
Juho Heikki Reijonen (1888-89)
Jooseppi Arra (1904-05)
Matti Mikael Jaakkola, myös kirkkoherran apulainen (1907-09)
Kirkkoherran apulaiset
Sven Abiel Heikel (1903-04)
Jooseppi Arra (1904-07)
Gustaf Immanuel Harvio e Hoffrén (1906-07)
August Riihimäki (1908)
Toivo Kansanen (1908)
Knut Fabian Perkiö (1909-)
Kappalaiset
Johan Agander (1787-94)
Johan Tuderus (1797-1815)
Johan Mårten Strömmer (1816-39)
Adam Virén (1841-47)
David Brummer (1849-77)
Gustaf Oskar Schöneman (1869-81)
Risto Pyysalo (1948-65)
I kappalainen
Matti Heikki Taipale (1966-78)
Risto Rafael Krogerus (1978-84)
Timo Sainio (1984-91)
Risto Rafael Krogerus (1992-93)
Maritta Katriina Tynkkynen (1994-)
II kappalainen
Raimo Johannes Rouhiainen (1964-78)
Kari Kalevi Kuittinen (1979-)
III kappalainen
Paavo Johannes Toivola (1978-97)
Arto Juhana Viitala (1997-)
Vt. kappalainen
Adam Melén (1809-12)
Gustaf Lindroos (1812-14)
Gustaf Varén (1814-16)
Adam Malén (1816)
Johan Mårten Strömmer (1816)
Adam Virén (1841)
Robert Vilhelm Brummer, kappalaisen sijainen, vt. kappalainen (1844-48)
Johan Adolf Alopaeus (1848-49)
Alfons Johan Alexander Lönnroth (1877-81)
Kappalaisen apulainen
Johan Georg Hofström (1830)
Lars Johan Kekoni, kappalaisen apulainen, sijainen, armovuodensaarnaaja (1831-41)
Konrad Edvard Tornberg (1855-57)
Gustaf Emanuel Bjöhrn (1858)
Tobias Hagelin (1864)
Karl Vilhelm Brummer (1873-74)
Elias Paajanen (1874)
Robert Ferdinand Bergh (1874-75)
Anders Vilhelm Leonard Gyllenbögel (1875-76)
Pitäjänapulaiset
Erik Lyra (1727-38)
Jakob Tuderus (1744-61)
Johan Borgstedt (1763-80)
Otto Reinhold Bökman (1780-87)